有区别。因为对于房屋价值的补偿是按照不低于周边新建的类似房地产的市场价。而厂房和商铺的市场价一般区别是比较大的。 法律依据：国务院令第590号，第十九条 对被征收房屋价值的补偿，不得低于房屋征收决定公告之日被征收房屋类似房地产的市场价格。被征收房屋.