房产申请退税的方法是在房产税流程走完后，去当地的交易核心办理退税登记，办理完毕之后，20个工作日到账。相关说明如下：1、个人住房房产税退税是针对居民拥有的房屋征收的一种特殊税种，在一定的条件下就可以进行减免免征。2、纳税人由于某种原因，误缴了房产税，或由于计算错误等原因多缴了房产税，报经税务机关核实后，可以办理退税手续，将已缴纳的税款予以退还。其计算方法是：退还误缴的税额＝已纳的误缴税款。退还多缴部分的税款＝已纳的税款-重新核实后的应纳税款。3、法律依据：中华人民共和国税收征收管理法，第五十一条，纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还；纳税人自结算缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还；涉及从国库中退库的，依照法律、行政法规有关国库管理的规定退还。
目前此政策已经取消。按照上海市政府的规定，凡在1998年6月1日至2003年5月31日共5年期间，购买上海市商品住宅或者差额换购商品房住宅（不含购公有住房），并在产权证列名为产权人，持有本市税务机关开具的个人所得税完税凭证的购房者，包括中国公民、外籍个人、华侨和香港、澳门、台湾同胞，不受户口限制，在产权证发证日期起的6个月内办理登记的，均可享受个人所得税计征税基（即个人应纳所得税额）抵扣。在这5年内，以不超过购房金额或者差价换购金额为限，其购房金额或者换购差价金额，可以在个人取得的以下各项应纳所得税额中抵扣:工资薪金所得；采用查帐征收的个体工商业户的生产经营所得；对企事业单位的承包经营、承租经营所得；稿酬所得；特许权使用费所得；利息、股息、红利所得（但不包括从上市公司取得的股息、红利所得和对私营企业投资者带征的股息、红利所得），退回以上项目已征收的个人所得税。